Пакет: seaview (1:5.0.5-2 и другие)
Ссылки для seaview
Ресурсы Debian:
- Сообщения об ошибках
- Developer Information
- Debian журнал изменений
- Файл авторских прав
- Отслеживание заплат Debian
Исходный код seaview:
Сопровождающие:
- Debian Med Packaging Team (Страница КК, Почтовый архив)
- Charles Plessy (Страница КК)
- Andreas Tille (Страница КК)
Внешние ресурсы:
- Сайт [doua.prabi.fr]
Подобные пакеты:
Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny
SeaView is a viewer and editor of multiple sequence alignments, i.e. DNA or protein sequences are positioned each in their own separate line, such that the nucleotide/amino acid at a particular position (column) is presumed to have the same biochemical property.
SeaView reads and writes various file formats (NEXUS, MSF, CLUSTAL, FASTA, PHYLIP, MASE, Newick) of DNA and protein sequences and of phylogenetic trees. Alignments can be manually edited. It drives the programs Muscle or Clustal Omega for multiple sequence alignment, and also allows one to use any external alignment algorithm able to read and write FASTA-formatted files. It computes phylogenetic trees by parsimony using PHYLIP's dnapars/protpars algorithm, by distance with NJ or BioNJ algorithms on a variety of evolutionary distances, or by maximum likelihood using the program PhyML 3.0.
SeaView draws phylogenetic trees on screen or PostScript files, and allows one to download sequences from EMBL/GenBank/UniProt using the Internet.
Другие пакеты, относящиеся к seaview
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
-
- dep: libfltk-images1.3t64
- Fast Light Toolkit - image loading support
-
- dep: libfltk1.3t64 (>= 1.3.4)
- Fast Light Toolkit - main shared library
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- вспомогательная библиотека GCC
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- стандартная библиотека GNU C++ версии 3
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- библиотека сжатия
Загрузка seaview
Архитектура | Версия | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
---|---|---|---|---|
amd64 | 1:5.0.5-2+b1 | 386,3 Кб | 1 016,0 Кб | [список файлов] |