Пакет: velvet (1.2.10+dfsg1-9) [debports]
Ссылки для velvet
Ресурсы Debian:
Исходный код :
Не найденСопровождающие:
Внешние ресурсы:
- Сайт [github.com]
Подобные пакеты:
Nucleic acid sequence assembler for very short reads
Velvet is a de novo genomic assembler specially designed for short read sequencing technologies, such as Solexa or 454, developed by Daniel Zerbino and Ewan Birney at the European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), near Cambridge, in the United Kingdom.
Velvet currently takes in short read sequences, removes errors then produces high quality unique contigs. It then uses paired read information, if available, to retrieve the repeated areas between contigs.
Другие пакеты, относящиеся к velvet
|
|
|
|
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34)
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb
-
- dep: libgomp1 (>= 4.9)
- вспомогательная библиотека GCC OpenMP (GOMP)
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2)
- библиотека сжатия
-
- sug: velvet-example
- Example data for the Velvet sequence assembler
Загрузка velvet
Архитектура | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
---|---|---|---|
alpha (неофициальный перенос) | 690,5 Кб | 1 718,0 Кб | [список файлов] |