Пакет: resfinder (4.4.2-1)
Ссылки для resfinder
Ресурсы Debian:
- Сообщения об ошибках
- Developer Information
- Debian журнал изменений
- Файл авторских прав
- Отслеживание заплат Debian
Исходный код resfinder:
- [resfinder_4.4.2-1.dsc]
- [resfinder_4.4.2.orig-debian-tests-data.tar.xz]
- [resfinder_4.4.2.orig.tar.xz]
- [resfinder_4.4.2-1.debian.tar.xz]
Сопровождающие:
- Debian Med Packaging Team (Страница КК, Почтовый архив)
- Andreas Tille (Страница КК)
- Étienne Mollier (Страница КК)
Внешние ресурсы:
- Сайт [bitbucket.org]
Подобные пакеты:
identify acquired antimicrobial resistance genes
ResFinder identifies acquired antimicrobial resistance genes in total or partial sequenced isolates of bacteria.
ResFinder that uses BLAST for identification of acquired antimicrobial resistance genes in whole-genome data. As input, the method can use both pre-assembled, complete or partial genomes, and short sequence reads from four different sequencing platforms. The method was evaluated on 1862 GenBank files containing 1411 different resistance genes, as well as on 23 de-novo-sequenced isolates.
Другие пакеты, относящиеся к resfinder
|
|
|
|
-
- dep: kma
- mapping genomic sequences to raw reads directly against redundant databases
-
- dep: ncbi-blast+-legacy
- NCBI Blast legacy call script
-
- dep: python3
- интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)
-
- dep: python3-cgecore
- Python3 module for the Center for Genomic Epidemiology
-
- dep: python3-cgelib
- Python3 code to be utilized across the CGE tools
-
- dep: python3-dateutil
- powerful extensions to the standard Python 3 datetime module
-
- dep: python3-git
- Python library to interact with Git repositories
-
- dep: python3-tabulate
- pretty-print tabular data in Python3
-
- dep: resfinder-db
- ResFinder database is a curated database of acquired resistance genes
Загрузка resfinder
Архитектура | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
---|---|---|---|
all | 66,3 Кб | 402,0 Кб | [список файлов] |