Пакет: sibelia (3.0.7+dfsg-4) [debports]
Ссылки для sibelia
Ресурсы Debian:
Исходный код :
Не найденСопровождающие:
Внешние ресурсы:
- Сайт [bioinf.spbau.ru]
Подобные пакеты:
Экспериментальный пакет
Предупреждение: данный пакет находится в экспериментальной ветке дистрибутива. Это означает, что он нестабилен или содержит ошибки, и даже может вызвать потерю данных. Перед использованием внимательно прочитайте файл changelog и другую доступную документацию.
comparative genomics tool
Sibelia (Synteny Block ExpLoration tool) is a comparative genomics tool: It assists biologists in analysing the genomic variations that correlate with pathogens, or the genomic changes that help microorganisms adapt in different environments. Sibelia will also be helpful for the evolutionary and genome rearrangement studies for multiple strains of microorganisms.
Sibelia is useful in finding:
1) shared regions, 2) regions that present in one group of genomes but not in others, 3) rearrangements that transform one genome to other genomes.
Другие пакеты, относящиеся к sibelia
|
|
|
|
-
- dep: lagan
- highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
-
- dep: libdivsufsort3 (>= 2.0.1)
- fast suffix array construction
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- вспомогательная библиотека GCC
-
- dep: libstdc++6 (>= 14)
- стандартная библиотека GNU C++ версии 3
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- sug: sibelia-examples
- comparative genomics tool (example data)
Загрузка sibelia
Архитектура | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
---|---|---|---|
x32 (неофициальный перенос) | 331,3 Кб | 1 175,0 Кб | [список файлов] |