Пакет: r-cran-phangorn (2.4.0-2 и другие)

[ Источник: r-cran-phangorn  ]

GNU R package for phylogenetic analysis

phangorn is a tool for reconstructing phylogenies, using distance-based methods, maximum parsimony or maximum likelihood, and performing Hadamard conjugation. It also offers functions for comparing trees, phylogenetic models or splits, simulating character data and performing congruence analysis.

Другие пакеты, относящиеся к r-cran-phangorn

• dep: libblas3

  реализация алгоритмов линейной алгебры — библиотека

  или libblas.so.3

  виртуальный пакет, предоставляемый libatlas3-base, libblas3, libblis2-openmp, libblis2-pthread, libblis2-serial, libopenblas-base

• dep: libc6 (>= 2.4)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.5)

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libgfortran5 (>= 8)

  Runtime library for GNU Fortran applications

• dep: liblapack3

  библиотека подпрограмм линейной алгебры вер. 3 — динамическая версия

  или liblapack.so.3

  виртуальный пакет, предоставляемый libatlas3-base, liblapack3, libopenblas-base

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

• dep: r-api-3.5

  виртуальный пакет, предоставляемый r-base-core

• dep: r-base-core (>= 3.5.1-1)

  GNU R core of statistical computation and graphics system

• dep: r-cran-ape (>= 5.0)

  GNU R package for Analyses of Phylogenetics and Evolution

• dep: r-cran-fastmatch

  GNU R package for fast match replacement for repeated look-ups

• dep: r-cran-igraph (>= 1.0)

  GNU R network analysis and visualization

• dep: r-cran-magrittr

  GNU R forward-pipe operator

• dep: r-cran-matrix

  GNU R package of classes for dense and sparse matrices

• dep: r-cran-quadprog

  GNU R package for solving quadratic programming problems

• dep: r-cran-rcpp (>= 0.12.0)

  GNU R package for Seamless R and C++ Integration

• rec: r-cran-testthat

  GNU R testsuite

• sug: r-bioc-biostrings

  GNU R string objects representing biological sequences

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-rgl

  GNU R package for three-dimensional visualisation using OpenGL

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

• sug: r-cran-seqinr

  GNU R biological sequences retrieval and analysis

• sug: r-cran-xtable

  GNU R coerce data to LaTeX and HTML tables

Загрузка r-cran-phangorn

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
armhf	2.4.0-2+b1	2 170,2 Кб	3 337,0 Кб	[список файлов]