Пакет: tvc (5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-2)

[ Источник: tvc  ]

genetic variant caller for Ion Torrent sequencing platforms

Torrent Variant Caller (TVC) is a genetic variant caller for Ion Torrent sequencing platforms, and is specially optimized to exploit the underlying flow signal information in the statistical model to evaluate variants. Torrent Variant Caller is designed to call single-nucleotide polymorphisms (SNPs), multi-nucleotide polymorphisms (MNPs), insertions, deletions, and block substitutions.

Другие пакеты, относящиеся к tvc

• dep: libarmadillo9 (>= 1:9.200.6+dfsg)

  streamlined C++ linear algebra library

• dep: libbamtools2.5.1

  dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files

• dep: libblas3

  реализация алгоритмов линейной алгебры — библиотека

  или libblas.so.3

  виртуальный пакет, предоставляемый libatlas3-base, libblas3, libblis2-openmp, libblis2-pthread, libblis2-serial, libopenblas-base

• dep: libc6 (>= 2.27)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libdisorder0 (>= 0.0.2)

  library for entropy measurement of byte streams

• dep: libgcc1 (>= 1:4.5)

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libjsoncpp1 (>= 1.7.4)

  library for reading and writing JSON for C++

• dep: liblapack3

  библиотека подпрограмм линейной алгебры вер. 3 — динамическая версия

  или liblapack.so.3

  виртуальный пакет, предоставляемый libatlas3-base, liblapack3, libopenblas-base

• dep: libsmithwaterman0 (>= 0.0+git20160702.2610e25)

  determine similar regions between two strings or genomic sequences (lib)

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

• dep: python

  интерактивный объектно-ориентированный язык высокого уровня (ветка 2.x)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  библиотека сжатия

Загрузка tvc

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
arm64	966,0 Кб	3 117,0 Кб	[список файлов]