Пакет: metastudent (2.0.1-6)

[ Источник: metastudent  ]

predictor of Gene Ontology terms from protein sequence

Often, only the sequence of a protein is known, but not its functions. Metastudent will try to predict missing functional annotations through homology searches (BLAST).

All predicted functions correspond to Gene Ontology (GO) terms from the Molecular Function (MFO), the Biological Process (BPO) and the Cellular Component Ontology (CCO) and are associated with a reliability score.

Другие пакеты, относящиеся к metastudent

• dep: blast2

  пустой переходный пакет для ncbi-blash+-legacy

• dep: default-jre

  Standard Java or Java compatible Runtime

• dep: libfile-chdir-perl

  more sensible way to change directories

• dep: libgo-perl (>= 0.15-3)

  perl modules for GO and other OBO ontologies

• dep: libgraphviz-perl

  Perl interface to the GraphViz graphing tool

• dep: libipc-run-perl

  Perl module for running processes

• dep: metastudent-data (>= 2.0.0)

  predictor of Gene Ontology terms from protein sequence - data files

• dep: perl

  практический язык Ларри Уолла для извлечения данных и составления отчётов

• dep: python

  интерактивный объектно-ориентированный язык высокого уровня (ветка 2.x)

Загрузка metastudent

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
all	5 853,9 Кб	94 959,0 Кб	[список файлов]