Пакет: scoary (1.6.16-1)

[ Источник: scoary  ]

pangenome-wide association studies

Scoary is designed to take the gene_presence_absence.csv file from Roary as well as a traits file created by the user and calculate the associations between all genes in the accessory genome and the traits. It reports a list of genes sorted by strength of association per trait.

Другие пакеты, относящиеся к scoary

• dep: python

  интерактивный объектно-ориентированный язык высокого уровня (ветка 2.x)

• dep: python (>= 2.7)

  интерактивный объектно-ориентированный язык высокого уровня (ветка 2.x)

  или python-argparse

  виртуальный пакет, предоставляемый libpython2.7-stdlib

• dep: python-pkg-resources

  обнаружение пакетов и доступ к ресурсам через pkg_resources

• dep: python-scipy

  scientific tools for Python

• sug: roary

  high speed stand alone pan genome pipeline

Загрузка scoary

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
all	228,8 Кб	2 686,0 Кб	[список файлов]