Пакет: mecat2 (0.0+git20200428.f54c542+ds-3)

[ Источник: mecat2  ]

ultra-fast and accurate de novo assembly tools for SMRT reads

An improved version of MECAT. It is an ultra-fast and accurate mapping and error correcting de novo assembly tools for single molecula sequencing (SMRT) reads. MECAT2 consists of the following three modules:

 1. mecat2map: a fast and accurate alignment tool for SMRT reads.
 2. mecat2cns: correct noisy reads based on their pairwise overlaps.
 3. fsa: a string graph based assembly tool.

Другие пакеты, относящиеся к mecat2

• dep: libc6 (>= 2.29)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  вспомогательная библиотека GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 6)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

• dep: perl

  практический язык Ларри Уолла для извлечения данных и составления отчётов

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  библиотека сжатия

Загрузка mecat2

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	749,5 Кб	4 053,0 Кб	[список файлов]