Пакет: sspace (2.1.1+dfsg-5)

Ссылки для sspace

Ресурсы Debian:

Исходный код sspace:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [github.com]

Подобные пакеты:

scaffolding pre-assembled contigs after extension

SSAKE-based Scaffolding of Pre-Assembled Contigs after Extension (SSPACE) is a script able to extend and scaffold pre-assembled contigs using one or more mate pairs or paired-end libraries, or even a combination.

SSPACE is built based on SSAKE. Code of SSAKE is changed to be able to extend and scaffold pre-assembled contigs for multiple paired reads libraries.

This is the free 'basic' version of SSPACE. The non-free 'standard' version is available directly from Baseclear.

Другие пакеты, относящиеся к sspace

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: bowtie

Ultrafast memory-efficient short read aligner
dep: perl

практический язык Ларри Уолла для извлечения данных и составления отчётов
dep: python3

интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)

Загрузка sspace

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
all	1 208,0 Кб	4 651,0 Кб	[список файлов]