Пакет: mmseqs2 (12-113e3+ds-3 и другие)

[ Источник: mmseqs2  ]

ultra fast and sensitive protein search and clustering

MMseqs2 (Many-against-Many sequence searching) is a software suite to search and cluster huge proteins/nucleotide sequence sets. MMseqs2 is open source GPL-licensed software implemented in C++ for Linux, MacOS, and (as beta version, via cygwin) Windows. The software is designed to run on multiple cores and servers and exhibits very good scalability. MMseqs2 can run 10000 times faster than BLAST. At 100 times its speed it achieves almost the same sensitivity. It can perform profile searches with the same sensitivity as PSI-BLAST at over 400 times its speed.

Другие пакеты, относящиеся к mmseqs2

• dep: libatomic1 (>= 4.8)

  библиотека для атомарного выполнения кода

• dep: libbz2-1.0

  библиотека сжатия по алгоритму Барроуза—Уилера (динамическая версия)

• dep: libc6 (>= 2.29)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.5)

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libgomp1 (>= 6)

  вспомогательная библиотека GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libgzstream0 (>= 1.5+dfsg)

  provide functionality of zlib C-library in a C++ iostream

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

• dep: libzstd1 (>= 1.4.0)

  быстрый алгоритм сжатия без потерь

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  библиотека сжатия

Загрузка mmseqs2

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
armel	12-113e3+ds-3+b1	4 368,0 Кб	7 590,0 Кб	[список файлов]