Пакет: tombo (1.5.1-2 и другие)

[ Источник: tombo  ]

identification of modified nucleotides from raw nanopore sequencing data

Tombo is a suite of tools primarily for the identification of modified nucleotides from nanopore sequencing data. Tombo also provides tools for the analysis and visualization of raw nanopore signal.

Другие пакеты, относящиеся к tombo

• dep: cython3

  C-Extensions for Python 3

• dep: libc6 (>= 2.29)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: python3

  интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)

  dep: python3 (<< 3.10)

  dep: python3 (>= 3.9~)

• dep: python3-h5py

  general-purpose Python interface to hdf5

• dep: python3-h5py-serial

  general-purpose Python interface to hdf5 (Python 3 serial)

• dep: python3-mappy

  Python3 interface minimap2

• dep: python3-numpy

  Fast array facility to the Python 3 language

• dep: python3-pkg-resources

  обнаружение пакетов и доступ к ресурсам через pkg_resources

• dep: python3-scipy

  scientific tools for Python 3

• dep: python3-tqdm

  fast, extensible progress bar for Python 3 and CLI tool

• rec: python3-pyfaidx

  efficient random access to fasta subsequences for Python 3

• rec: python3-rpy2

  Python3 interface to the GNU R language and environment (version 2)
  также виртуальный пакет, предоставляемый python3-rpy2

Загрузка tombo

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
arm64	1.5.1-2+b2	410,8 Кб	1 395,0 Кб	[список файлов]