Пакет: murasaki-common (1.68.6-12)

[ Источник: murasaki  ]

homology detection tool across multiple large genomes (common files)

Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.

Murasaki is an anchor alignment software, which is

 * exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with
   40 nodes: 52 wall minutes))
 * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI.
   Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.)
 * unlimited pattern length
 * repeat tolerant
 * intelligent noise reduction

This package contains all files that are common to the single core murasaki package and the multi core murasaki-mpi package.

Другие пакеты, относящиеся к murasaki-common

• dep: gnuplot

  утилита для построения графиков с интерфейсом командной строки
  также виртуальный пакет, предоставляемый gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11

  или gnuplot5

  Пакет недоступен

• dep: imagemagick

  программы для работы с изображениями — двоичные файлы
  также виртуальный пакет, предоставляемый graphicsmagick-imagemagick-compat, imagemagick-6.q16

• dep: libbio-perl-perl

  BioPerl core perl modules

• dep: r-cran-rocr

  GNU R package to prepare and display ROC curves

• rec: libterm-readkey-perl

  модуль Perl для простого управления терминалом

• rec: libtext-wrapi18n-perl

  интернационализованный вариант Text::Wrap

  или libtext-wrapper-perl

  simple word wrapping routine

Загрузка murasaki-common

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
all	142,1 Кб	433,0 Кб	[список файлов]