Пакет: vt (0.57721+ds-3)

[ Источник: vt  ]

toolset for short variant discovery in genetic sequence data

vt is a variant tool set that discovers short variants from Next Generation Sequencing data.

Vt-normalize is a tool to normalize representation of genetic variants in the VCF. Variant normalization is formally defined as the consistent representation of genetic variants in an unambiguous and concise way. In vt a simple general algorithm to enforce this is implemented.

Другие пакеты, относящиеся к vt

• dep: libc6 (>= 2.29)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libhts3 (>= 1.10)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libpcre2-8-0 (>= 10.22)

  новая библиотека поддержки регулярных выражений Perl — 8-битный вариант

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

• dep: r-base-core

  GNU R core of statistical computation and graphics system

Загрузка vt

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	756,2 Кб	2 565,0 Кб	[список файлов]
arm64	624,3 Кб	2 241,0 Кб	[список файлов]
armel	604,2 Кб	2 152,0 Кб	[список файлов]
armhf	624,4 Кб	1 524,0 Кб	[список файлов]
i386	763,0 Кб	2 776,0 Кб	[список файлов]
mips64el	576,1 Кб	3 225,0 Кб	[список файлов]
mipsel	580,6 Кб	2 977,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	693,5 Кб	2 833,0 Кб	[список файлов]
s390x	638,5 Кб	2 533,0 Кб	[список файлов]