Пакет: velvet-long (1.2.10+dfsg1-8)

[ Источник: velvet  ]

Nucleic acid sequence assembler for very short reads, long version

Velvet is a de novo genomic assembler specially designed for short read sequencing technologies, such as Solexa or 454, developed by Daniel Zerbino and Ewan Birney at the European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), near Cambridge, in the United Kingdom.

Velvet currently takes in short read sequences, removes errors then produces high quality unique contigs. It then uses paired read information, if available, to retrieve the repeated areas between contigs.

This package installs special long-mode versions of Velvet, as recommended in the Velvet tutorials.

Другие пакеты, относящиеся к velvet-long

• dep: libc6 (>= 2.34)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  вспомогательная библиотека GCC OpenMP (GOMP)

• dep: velvet

  Nucleic acid sequence assembler for very short reads

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2)

  библиотека сжатия

Загрузка velvet-long

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	205,8 Кб	1 832,0 Кб	[список файлов]
arm64	186,7 Кб	1 990,0 Кб	[список файлов]
armel	216,1 Кб	2 309,0 Кб	[список файлов]
armhf	193,0 Кб	1 350,0 Кб	[список файлов]
i386	237,8 Кб	2 344,0 Кб	[список файлов]
mips64el	193,8 Кб	2 440,0 Кб	[список файлов]
mipsel	227,1 Кб	2 740,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	213,6 Кб	2 635,0 Кб	[список файлов]
s390x	192,1 Кб	1 942,0 Кб	[список файлов]