[ Источник: samblaster ]
Пакет: samblaster (0.1.26-4)
Ссылки для samblaster
Ресурсы Debian:
- Сообщения об ошибках
- Developer Information
- Debian журнал изменений
- Файл авторских прав
- Отслеживание заплат Debian
Исходный код samblaster:
Сопровождающие:
Внешние ресурсы:
- Сайт [github.com]
Подобные пакеты:
marks duplicates, extracts discordant/split reads
Current "next-generation" sequencing technologies cannot tell what exact sequence they will be reading. They take what is available. And if some sequences are read very often, then this needs some extra biomedical thinking. The genome could for instance be duplicated.
samblaster is a fast and flexible program for marking duplicates in read-id grouped paired-end SAM files. It can also optionally output discordant read pairs and/or split read mappings to separate SAM files, and/or unmapped/clipped reads to a separate FASTQ file. When marking duplicates, samblaster will require approximately 20MB of memory per 1M read pairs.
Другие пакеты, относящиеся к samblaster
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
-
- dep: libstdc++6 (>= 5)
- стандартная библиотека GNU C++ версии 3
Загрузка samblaster
| Архитектура | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
|---|---|---|---|
| ppc64el | 26,5 Кб | 86,0 Кб | [список файлов] |