Пакет: megadepth (1.2.0-4)

[ Источник: megadepth  ]

computes coverage from BigWig and BAM sequencing files

A major concern for the interpretation of DNA and RNA (!) sequencing is the number of reads that cover a particular area. This package has interesting statistics for the distinction of coding and non-coding parts of the genome and knows how to interpret transcripts that span multiple exons.

This package is a successor of the program 'bamcount'.

Другие пакеты, относящиеся к megadepth

• dep: libbigwig0 (>= 0.4.6+dfsg)

  C library for handling bigWig files

• dep: libc6 (>= 2.17)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libhts3 (>= 1.10)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

• sug: r-bioc-megadepth

  BioCOnductor BigWig and BAM related utilities

Загрузка megadepth

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
ppc64el	81,5 Кб	338,0 Кб	[список файлов]