[ Источник: mafft ]
Пакет: mafft (7.505-1)
Ссылки для mafft
Ресурсы Debian:
- Сообщения об ошибках
- Developer Information
- Debian журнал изменений
- Файл авторских прав
- Отслеживание заплат Debian
Исходный код mafft:
Сопровождающие:
- Debian Med Packaging Team (Страница КК, Почтовый архив)
- Charles Plessy (Страница КК)
- Andreas Tille (Страница КК)
Внешние ресурсы:
- Сайт [mafft.cbrc.jp]
Подобные пакеты:
Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences
MAFFT is a multiple sequence alignment program which offers three accuracy-oriented methods:
* L-INS-i (probably most accurate; recommended for <200 sequences; iterative refinement method incorporating local pairwise alignment information), * G-INS-i (suitable for sequences of similar lengths; recommended for <200 sequences; iterative refinement method incorporating global pairwise alignment information), * E-INS-i (suitable for sequences containing large unalignable regions; recommended for <200 sequences),and five speed-oriented methods:
* FFT-NS-i (iterative refinement method; two cycles only), * FFT-NS-i (iterative refinement method; max. 1000 iterations), * FFT-NS-2 (fast; progressive method), * FFT-NS-1 (very fast; recommended for >2000 sequences; progressive method with a rough guide tree), * NW-NS-PartTree-1 (recommended for ∼50,000 sequences; progressive method with the PartTree algorithm).
Другие пакеты, относящиеся к mafft
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
-
- dep: perl
- практический язык Ларри Уолла для извлечения данных и составления отчётов
-
- rec: blast2
- Пакет недоступен
-
- rec: libwww-perl
- простой и надёжный интерфейс для Всемирной паутины
-
- rec: lynx
- класcический веб-браузер для текстового режима
-
- rec: ruby
- интерпретатор объектно-ориентированного языка сценариев Ruby (основная версия)
-
- enh: t-coffee
- Multiple Sequence Alignment
Загрузка mafft
Архитектура | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
---|---|---|---|
mipsel | 932,1 Кб | 14 174,0 Кб | [список файлов] |