все параметры
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Источник: mafft  ]

Пакет: mafft (7.505-1)

Ссылки для mafft

Screenshot

Ресурсы Debian:

Исходный код mafft:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Подобные пакеты:

Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences

MAFFT is a multiple sequence alignment program which offers three accuracy-oriented methods:

 * L-INS-i (probably most accurate; recommended for <200 sequences;
   iterative refinement method incorporating local pairwise alignment
   information),
 * G-INS-i (suitable for sequences of similar lengths; recommended for
   <200 sequences; iterative refinement method incorporating global
   pairwise alignment information),
 * E-INS-i (suitable for sequences containing large unalignable regions;
   recommended for <200 sequences),
and five speed-oriented methods:
 * FFT-NS-i (iterative refinement method; two cycles only),
 * FFT-NS-i (iterative refinement method; max. 1000 iterations),
 * FFT-NS-2 (fast; progressive method),
 * FFT-NS-1 (very fast; recommended for >2000 sequences; progressive
   method with a rough guide tree),
 * NW-NS-PartTree-1 (recommended for ∼50,000 sequences; progressive
   method with the PartTree algorithm).

Теги: Биология: Clustal/ALN, Протеины, Область: field::biology, field::biology:bioinformatics, Реализовано на: implemented-in::c, interface::commandline, Роль: Программа, Область: Утилита, Цель: use::comparing, works-with-format::plaintext, Работает с: Биологические последовательности

Другие пакеты, относящиеся к mafft

  • зависимости
  • рекомендации
  • предложения
  • enhances

Загрузка mafft

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура Размер пакета В установленном виде Файлы
mips64el 873,9 Кб14 427,0 Кб [список файлов]