Пакет: blasr (5.3.5+dfsg-6)

[ Источник: blasr  ]

mapping single-molecule sequencing reads

Basic local alignment with successive refinement (BLASR) is a method for mapping single-molecule sequencing reads against a reference genome. Such reads are thousands of bases long, with divergence between them and the genome being dominated by insertion and deletion error.

Другие пакеты, относящиеся к blasr

• dep: libblasr5.3.5 (>= 5.3.5+dfsg)

  tools for aligning PacBio reads to target sequences

• dep: libc6 (>= 2.34)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libhdf5-cpp-103-1 (>= 1.10.5)

  HDF5 - C++ runtime files - serial version

• dep: libpbbam2.1.0 (>= 2.1.0+dfsg)

  Pacific Biosciences binary alignment/map (BAM) library

• dep: libpbcopper2.0.0 (>= 2.0.0+dfsg)

  data structures, algorithms, and utilities for C++ applications

• dep: libpbseq (>= 5.3.5+dfsg-4~)

  library for analyzing PacBio sequencing data

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

Загрузка blasr

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
arm64	190,2 Кб	616,0 Кб	[список файлов]