Пакет: artemis (18.2.0+dfsg-3)

[ Источник: artemis  ]

genome browser and annotation tool

Artemis is a genome browser and annotation tool that allows visualisation of sequence features, next generation data and the results of analyses within the context of the sequence, and also its six-frame translation.

This package includes the Artemis genome browser, the Artemis Comparison Tool (ACT), and the DNAplotter and BamView utilities.

Теги: Область: Биология, Биоинформатика, Реализовано на: implemented-in::java, interface::commandline, Пользовательский интерфейс: Graphical User Interface, interface::x11, role::program, Область: Утилита, Цель: Анализ, use::comparing, use::editing, Работает с: Биологические последовательности, X Window System: Приложение

Другие пакеты, относящиеся к artemis

• dep: default-jre

  Standard Java or Java compatible Runtime

• dep: jemboss

  graphical user interface to EMBOSS

• dep: libbatik-java (>= 1.16)

  xml.apache.org SVG Library

• dep: libbiojava-java (>= 1:1.9.5+dfsg)

  Java API to biological data and applications (default version)

• dep: libcglib-java (>= 3.3.0)

  Code generation library for Java

• dep: libcommons-lang3-java

  Apache Commons Lang utility classes

• dep: libcommons-logging-java (>= 1.2)

  common wrapper interface for several logging APIs

• dep: libcommons-net-java

  Apache Commons Net - Java client API for basic Internet protocols

• dep: libhtsjdk-java

  Java API for high-throughput sequencing data (HTS) formats

• dep: libibatis-java (>= 2.3.4.726)

  iBATIS Data Mapper framework

• dep: libj2ssh-java (>= 0.2.9)

  Java library for the SSH protocol

• dep: liblog4j1.2-java

  Logging library for java

• dep: libpicard-java

  Java library to manipulate SAM and BAM files

• dep: libpostgresql-jdbc-java

  Java database (JDBC) driver for PostgreSQL

Загрузка artemis

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
all	3 710,6 Кб	20 783,0 Кб	[список файлов]