Pacote: meryl (0~20150903+r2013-9 e outros)

[ Fonte: kmer  ]

in- and out-of-core kmer counting and utilities

meryl computes the kmer content of genomic sequences. Kmer content is represented as a list of kmers and the number of times each occurs in the input sequences. The kmer can be restricted to only the forward kmer, only the reverse kmer, or the canonical kmer (lexicographically smaller of the forward and reverse kmer at each location). Meryl can report the histogram of counts, the list of kmers and their counts, or can perform mathematical and set operations on the processed data files.

This package is part of the Kmer suite.

Outros pacotes relacionados a meryl

• dep: libc6 (>= 2.38)

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [não armel, armhf, i386, riscv64]

  Biblioteca de suporte GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]

• dep: libstdc++6 (>= 4.1.1)

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

• sug: gridengine-client

  Pacote não disponível

Download de meryl

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Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	0~20150903+r2013-9+b1	195.8 kB	1,458.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	0~20150903+r2013-9+b1	189.4 kB	1,572.0 kB	[lista de arquivos]
armel	0~20150903+r2013-9+b1	201.0 kB	1,635.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	0~20150903+r2013-9+b1	200.7 kB	1,379.0 kB	[lista de arquivos]
i386	0~20150903+r2013-9+b1	233.7 kB	1,835.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	0~20150903+r2013-9+b1	213.3 kB	1,821.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	0~20150903+r2013-9+b1	209.9 kB	1,765.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	0~20150903+r2013-9+b1	213.9 kB	1,286.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	0~20150903+r2013-9+b1	178.7 kB	1,483.0 kB	[lista de arquivos]