Pacote: amap-align (2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2 e outros)

[ Fonte: amap-align  ]

Protein multiple alignment by sequence annealing

AMAP is a command line tool to perform multiple alignment of peptidic sequences. It utilizes posterior decoding, and a sequence-annealing alignment, instead of the traditional progressive alignment method. It is the only alignment program that allows one to control the sensitivity / specificity tradeoff. It is based on the ProbCons source code, but uses alignment metric accuracy and eliminates the consistency transformation.

The Java visualisation tool of AMAP 2.2 is not yet packaged in Debian.

Etiquetas: Campo: Biologia, Bioinformática, Implementado em: implemented-in::c++, interface::commandline, Função: Programa, Alcance: Utilitários, Propósito: use::analysing, use::comparing, Suporta o formato: Texto puro, Funciona com: Precisa de uma etiqueta extra

Outros pacotes relacionados a amap-align

• dep: libc6 (>= 2.27) [não arm64, riscv64]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [não armel, armhf]

  Biblioteca de suporte GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [arm64, riscv64]

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf, s390x]

  dep: libstdc++6 (>= 9) [amd64, i386, mips64el, ppc64el]

Download de amap-align

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	129.2 kB	1,214.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2+b1	134.0 kB	1,228.0 kB	[lista de arquivos]
armel	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	106.8 kB	1,174.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	107.2 kB	1,118.0 kB	[lista de arquivos]
i386	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	112.0 kB	1,186.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	128.3 kB	1,216.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	140.3 kB	1,230.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2+b1	134.2 kB	1,156.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2	109.2 kB	1,202.0 kB	[lista de arquivos]