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Pacote: autodock (4.2.6-9) [debports]

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análise das ligações do ligante à estrutura de proteína

AutoDock é um representante único dos programas que tratam a simulação da atracagem indo de ligantes químicos bem pequenos até receptores grandes de proteínas. Versões anteriores tinham toda a flexibilidade nos ligantes enquanto a proteína era mantida rígida. Esta última versão 4 também permite flexibilidade de cadeias laterais selecionadas dos resíduos de superfície, i.e., leva os "rotamers" em consideração.

O programa AutoDock realiza a atracagem do ligante a um conjunto de grades descrevendo a proteína alvo. O AutoGrid pré-calcula estas grades.

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