Pacote: seqprep (1.3.2-9 e outros)

Links para seqprep

Recursos de Debian:

Baixe o pacote-fonte seqprep:

Mantenedores(as):

Debian Med Packaging Team (QA Página, E-mail Arquivo)
Tim Booth (QA Página)
Andreas Tille (QA Página)
Nilesh Patra (QA Página)

Fontes externas:

Pagina principal [seqanswers.com]

Pacotes similares:

stripping adaptors and/or merging paired reads of DNA sequences with overlap

SeqPrep is a program to merge paired end Illumina reads that are overlapping into a single longer read. It may also just be used for its adapter trimming feature without doing any paired end overlap. When an adapter sequence is present, that means that the two reads must overlap (in most cases) so they are forcefully merged. When reads do not have adapter sequence they must be treated with care when doing the merging, so a much more specific approach is taken. The default parameters were chosen with specificity in mind, so that they could be ran on libraries where very few reads are expected to overlap. It is always safest though to save the overlapping procedure for libraries where you have some prior knowledge that a significant portion of the reads will have some overlap.

Outros pacotes relacionados a seqprep

depende

recomenda

sugere

melhora

dep: libc6 (>= 2.34) [não alpha, ia64, loong64, sh4]

GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [loong64, sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
também um pacote virtual fornecido por libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [não armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

biblioteca de compressão - runtime (tempo de execução)

dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

Download de seqprep

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis
Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
alpha (porte não oficial)	1.3.2-9	26.7 kB	167.0 kB	[lista de arquivos]
amd64	1.3.2-9	27.5 kB	99.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	1.3.2-9+b1	26.6 kB	104.0 kB	[lista de arquivos]
armel	1.3.2-9	28.0 kB	110.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	1.3.2-9	26.6 kB	82.0 kB	[lista de arquivos]
hppa (porte não oficial)	1.3.2-9	28.4 kB	131.0 kB	[lista de arquivos]
i386	1.3.2-9	27.3 kB	90.0 kB	[lista de arquivos]
ia64 (porte não oficial)	1.3.2-9	33.7 kB	185.0 kB	[lista de arquivos]
loong64 (porte não oficial)	1.3.2-9	27.1 kB	103.0 kB	[lista de arquivos]
m68k (porte não oficial)	1.3.2-9	26.2 kB	94.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	1.3.2-9	26.7 kB	169.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64 (porte não oficial)	1.3.2-9	26.4 kB	167.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	1.3.2-9	26.4 kB	103.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	1.3.2-9	28.1 kB	99.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	1.3.2-9	26.6 kB	103.0 kB	[lista de arquivos]
sh4 (porte não oficial)	1.3.2-9	32.4 kB	102.0 kB	[lista de arquivos]
sparc64 (porte não oficial)	1.3.2-9	26.3 kB	1,064.0 kB	[lista de arquivos]
x32 (porte não oficial)	1.3.2-9	27.5 kB	98.0 kB	[lista de arquivos]