Pacote: abyss (2.3.5+dfsg-2) [debports]

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montador sequencial, paralelo, de novo para leituras curtas

ABySS é um montador paralelo, sequencial, 'de novo', concebido para leituras curtas. Pode ser utilizado para montar dados de sequência de genoma ou transcritoma. A paralelização é conseguida utilizando MPI, OpenMP e pthread.

Outros pacotes relacionados a abyss

• dep: bsdextrautils

  utilitários extras do 4.4BSD-Lite

• dep: libc6.1 (>= 2.35)

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 4.2)

  Biblioteca de suporte GCC

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  biblioteca de suporte ao GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libopenmpi3 (>= 4.1.4)

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  biblioteca compartilhada SQLite 3

• dep: libstdc++6 (>= 12)

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

• dep: libunwind8

  biblioteca para determinar a cadeia de chamadas de um programa - execução

• dep: make

  utilitário para compilação direta

• dep: openmpi-bin

  biblioteca de passagem de mensagens de alto desempenho -- binários

• dep: openmpi-common

  high performance message passing library -- common files

• dep: perl

  Linguagem de extração e relatórios prática de Larry Wall

Download de abyss

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
ia64 (porte não oficial)	3,493.2 kB	17,029.0 kB	[lista de arquivos]