Pacote: perm (0.4.0-8 e outros)

[ Fonte: perm  ]

efficient mapping of short reads with periodic spaced seeds

PerM is a software package which was designed to perform highly efficient genome scale alignments for hundreds of millions of short reads produced by the ABI SOLiD and Illumina sequencing platforms. Today PerM is capable of providing full sensitivity for alignments within 4 mismatches for 50bp SOLID reads and 9 mismatches for 100bp Illumina reads.

Outros pacotes relacionados a perm

• dep: libbsd0 (>= 0.0)

  funções utilitárias de sistemas BSD - biblioteca compartilhada

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.5)

  Biblioteca de suporte GCC

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  biblioteca de suporte ao GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

Download de perm

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
armel	0.4.0-8+b1	108.0 kB	348.0 kB	[lista de arquivos]