Pacote: hmmer2 (2.3.2+dfsg-6)

[ Fonte: hmmer2  ]

perfis "hidden Markov models" para análise de seqüência de proteína

HMMER é uma implementação do métodos de perfil "hidden Markov model" (modelo Markov oculto) para buscas sensíveis de bases de dados de seqüências biológicas usando múltiplas seqüências de alinhamento como consultas.

Dada uma múltipla seqüência de alinhamento como entrada, HMMER constrói um modelo estatístico chamado "hidden Markov model" (modelo Markov oculto) que pode então ser usado como uma consulta em um banco de dados de seqüências para encontrar (e/ou alinhar) homólogos adicionais da família da seqüência.

Outros pacotes relacionados a hmmer2

• dep: libc6 (>= 2.17)

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

• dep: libpvm3

  Parallel Virtual Machine - shared libraries

• dep: libsquid1

  biosquid dynamic library for biological sequence analysis

• rec: biosquid

  utilities for biological sequence analysis

• sug: hmmer2-doc (>= 2.3.2+dfsg-6)

  profile hidden Markov models for protein sequence analysis (docs)

• sug: hmmer2-pvm (>= 2.3.2+dfsg-6)

  programas HMMER com suporte a PVM (Parallel Virtual Machine)

Download de hmmer2

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Arquitetura	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
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