Pacote: uncalled (2.2+ds-1)

[ Fonte: uncalled  ]

Utility for Nanopore Current Alignment to Large Expanses of DNA

Streaming algorithm for mapping raw nanopore signal to DNA references

Enables real-time enrichment or depletion on Oxford Nanopore Technologies (ONT) MinION runs via ReadUntil.

Also supports standalone signal mapping of fast5 reads

Outros pacotes relacionados a uncalled

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x]

  Biblioteca de suporte GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64, mips64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]

• dep: libhdf5-103-1

  HDF5 C runtime files - serial version

• dep: libstdc++6 (>= 10.2) [armel]

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 6) [armhf]

  dep: libstdc++6 (>= 9) [não armel, armhf]

• dep: python3

  linguagem orientada a objetos de alto nível e interativa (versão padrão da python3)

  dep: python3 (<< 3.10)

  dep: python3 (>= 3.9~)

• dep: python3-numpy

  Fast array facility to the Python 3 language

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  biblioteca de compressão - runtime (tempo de execução)

Download de uncalled

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	542.2 kB	1,901.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	492.2 kB	1,733.0 kB	[lista de arquivos]
armel	471.3 kB	1,592.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	488.2 kB	1,268.0 kB	[lista de arquivos]
i386	569.4 kB	1,868.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	458.8 kB	1,950.0 kB	[lista de arquivos]
mipsel	483.5 kB	1,970.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	533.7 kB	2,037.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	488.0 kB	1,869.0 kB	[lista de arquivos]