Pacote: pbsim (1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3)

[ Fonte: pbsim  ]

simulator for PacBio sequencing reads

PacBio DNA sequencers produce two types of characteristic reads: CCS (short and low error rate) and CLR (long and high error rate), both of which could be useful for de novo assembly of genomes. PBSIM simulates those PacBio reads from a reference sequence by using either a model-based or sampling-based simulation. Simulated reads are useful, for example, when developing or evaluating sequence assemblers targeted at PacBio data.

Etiquetas: Biologia: Ácidos nucleicos, Campo: Biologia, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c++, Função: Programa, Propósito: use::simulating, works-with::biological-sequence

Outros pacotes relacionados a pbsim

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  Biblioteca de suporte GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [mipsel]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

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Arquitetura	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	24.9 kB	100.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	24.1 kB	120.0 kB	[lista de arquivos]
armel	24.5 kB	91.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	23.9 kB	83.0 kB	[lista de arquivos]
i386	25.8 kB	99.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	25.4 kB	122.0 kB	[lista de arquivos]
mipsel	25.8 kB	121.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	27.1 kB	120.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	23.6 kB	92.0 kB	[lista de arquivos]