Pakiet: python3-bx (0.13.0-1 i inne)

[ Pakiet źródłowy: python-bx  ]

library to manage genomic data and its alignment

The bx-python project is a Python3 library and associated set of scripts to allow for rapid implementation of genome scale analyses. The library contains a variety of useful modules, but the particular strengths are:

 * Classes for reading and working with genome-scale multiple local
   alignments (in MAF, AXT, and LAV formats)
 * Generic data structure for indexing on disk files that contain blocks of
   data associated with intervals on various sequences (used, for example, to
   provide random access to individual alignments in huge files; optimized
   for use over network filesystems)
 * Data structures for working with intervals on sequences
 * "Binned bitsets" which act just like chromosome sized bit arrays, but
   lazily allocate regions and allow large blocks of all set or all unset
   bits to be stored compactly
 * "Intersecter" for performing fast intersection tests that preserve both
   query and target intervals and associated annotation

Inne pakiety związane z python3-bx

• dep: libc6 (>= 2.11)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: python3

  Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

  dep: python3 (<< 3.14)

  dep: python3 (>= 3.12~)

• dep: python3-lzo

  Python bindings for the LZO data compression library (Python 3)

• dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0)

  Szybkie zarządzanie tablicami w języku Python (Python 3)

• dep: python3-numpy-abi9

  pakiet wirtualny udostępniany przez python3-numpy

• dep: python3-pyparsing

  alternative to creating and executing simple grammars - Python 3.x

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie python3-bx

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
s390x	0.13.0-1+b1	872,8 KiB	5 830,0 KiB	[lista plików]