Pakiet: bcftools (1.20-2)

[ Pakiet źródłowy: bcftools  ]

Wywoływanie wariantów genomowych oraz zarządzanie plikami VCF i BCF

BCFtools to zestaw narzędzi, które manipulują wywołaniami wariantowymi w formacie Variant Call Format (VCF) i jego binarnym odpowiedniku BCF. Wszystkie polecenia działają w sposób przejrzysty zarówno z plikami VCF, jak i BCF, zarówno nieskompresowanymi, jak i skompresowanymi przy użyciu BGZF.

Znaczniki: Zaimplementowane w: C, Rola: Program

Inne pakiety związane z bcftools

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• rec: perl

  praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla

• rec: python3-gffutils

  Work with GFF and GTF files in a flexible database framework

• rec: python3-matplotlib

  System do rysowania wykresów oparty na Pythonie w stylu podobnym do Matlaba

• sug: python3

  Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

• sug: python3-numpy

  Szybkie zarządzanie tablicami w języku Python (Python 3)

• sug: texlive-latex-recommended

  TeX Live: LaTeX recommended packages

Pobieranie bcftools

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
riscv64	735,9 KiB	2 184,0 KiB	[lista plików]