Pakiet: python3-biopython (1.84+dfsg-4)

[ Pakiet źródłowy: python-biopython  ]

Python3 library for bioinformatics

The Biopython Project is an international association of developers of freely available Python tools for computational molecular biology.

It is a distributed collaborative effort to develop Python3 libraries and applications which address the needs of current and future work in bioinformatics. The source code is made available under the Biopython License, which is extremely liberal and compatible with almost every license in the world. The project works along with the Open Bioinformatics Foundation, who generously provide web and CVS space for the project.

Inne pakiety związane z python3-biopython

• dep: libc6 (>= 2.17)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: python3

  Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

  dep: python3 (<< 3.13)

  dep: python3 (>= 3.12~)

• dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0)

  Szybkie zarządzanie tablicami w języku Python (Python 3)

• dep: python3-numpy-abi9

  pakiet wirtualny udostępniany przez python3-numpy

• dep: python3-reportlab (>= 4.0.4-1~)

  ReportLab library to create PDF documents using Python3

• dep: w3c-sgml-lib

  w3.org DTD and catalog files

• rec: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

• rec: python-biopython-doc (= 1.84+dfsg-4)

  Documentation for the Biopython library

• sug: bwa

  Burrows-Wheeler Aligner

• sug: clustalo

  General-purpose multiple sequence alignment program for proteins

• sug: clustalw

  global multiple nucleotide or peptide sequence alignment

• sug: dialign

  Dopasowanie wielu sekwencji w oparciu o segmenty

• sug: dssp

  Ustalanie drugorzędowej struktury białek na podstawie struktury 3D

• sug: emboss

  European molecular biology open software suite

• sug: fasttree

  phylogenetic trees from alignments of nucleotide or protein sequences

• sug: mafft

  Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences

• sug: muscle3

  multiple alignment program of protein sequences

• sug: phylip

  package of programs for inferring phylogenies

• sug: phyml

  Phylogenetic estimation using Maximum Likelihood

• sug: prank

  Probabilistic Alignment Kit for DNA, codon and amino-acid sequences

• sug: probcons

  PROBabilistic CONSistency-based multiple sequence alignment

• sug: python3-matplotlib

  System do rysowania wykresów oparty na Pythonie w stylu podobnym do Matlaba

• sug: python3-mmtf

  binary encoding of biological structures (Python 3)

• sug: python3-mysqldb

  Python interface to MySQL

• sug: python3-pil

  Biblioteka obrazowania w Pythonie (Python 3)

• sug: python3-psycopg2

  Python 3 module for PostgreSQL

• sug: python3-rdflib

  Python 3 library containing an RDF triple store and RDF parsers/serializers

• sug: python3-scipy

  Narzędzia naukowe dla Pythona 3

• sug: python3-tk

  Tkinter - Writing Tk applications with Python 3.x

• sug: raxml

  Randomizowane maksymalne prawdopodobieństwo drzew filogenetycznych

• sug: samtools

  Przetwarzanie dopasowań sekwencji w formatach SAM, BAM i CRAM

• sug: t-coffee

  Wielosekwencyjne wyrównanie

• sug: wise

  comparison of biopolymers, like DNA and protein sequences

Pobieranie python3-biopython

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
ppc64el	1 621,9 KiB	12 220,0 KiB	[lista plików]