Pakiet: phast (1.6+dfsg-6)

[ Pakiet źródłowy: phast  ]

phylogenetic analysis with space/time models

PHAST is a software package for comparative and evolutionary genomics. It consists of about half a dozen major programs, plus more than a dozen utilities for manipulating sequence alignments, phylogenetic trees, and genomic annotations. For the most part, PHAST focuses on two kinds of applications: the identification of novel functional elements, including protein-coding exons and evolutionarily conserved sequences; and statistical phylogenetic modeling, including estimation of model parameters, detection of signatures of selection, and reconstruction of ancestral sequences.

PHAST does not support phylogeny reconstruction or sequence alignment, and it is designed for use with DNA sequences only (see Comparison).

Inne pakiety związane z phast

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: liblapack3

  Library of linear algebra routines 3 - shared version

  lub liblapack.so.3

  pakiet wirtualny udostępniany przez liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libpcre2-8-0 (>= 10.22)

  Nowa biblioteka wyrażeń regularnych zgodna z Perl - 8-bitowe pliki uruchomieniowe

Pobieranie phast

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	2 971,1 KiB	25 691,0 KiB	[lista plików]
arm64	2 815,6 KiB	25 262,0 KiB	[lista plików]
armel	2 606,3 KiB	23 241,0 KiB	[lista plików]
armhf	2 504,3 KiB	17 389,0 KiB	[lista plików]
i386	3 017,5 KiB	27 259,0 KiB	[lista plików]
mips64el	2 856,8 KiB	29 065,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	3 174,3 KiB	31 278,0 KiB	[lista plików]
riscv64	2 951,9 KiB	20 510,0 KiB	[lista plików]
s390x	2 839,6 KiB	28 115,0 KiB	[lista plików]