Pakiet: python3-freecontact (1.1-8)
Odnośniki dla python3-freecontact
Zasoby systemu Debian:
- Raporty o błędach
- Developer Information
- Dziennik zmian w systemie Debian
- Informacje nt. praw autorskich
- Śledzenie łatek systemu Debian
Pobieranie pakietu źródłowego python-freecontact:
- [python-freecontact_1.1-8.dsc]
- [python-freecontact_1.1.orig.tar.gz]
- [python-freecontact_1.1-8.debian.tar.xz]
Opiekunowie:
- Debian Med Packaging Team (Strona QA, Archiwum e-mail)
- Laszlo Kajan (Strona QA)
- Andreas Tille (Strona QA)
- Alexandre Mestiashvili (Strona QA)
Zasoby zewnętrzne:
- Strona internetowa [rostlab.org]
Podobne pakiety:
fast protein contact predictor - binding for Python3
FreeContact is a protein residue contact predictor optimized for speed. Its input is a multiple sequence alignment. FreeContact can function as an accelerated drop-in for the published contact predictors EVfold-mfDCA of DS. Marks (2011) and PSICOV of D. Jones (2011).
FreeContact is accelerated by a combination of vector instructions, multiple threads, and faster implementation of key parts. Depending on the alignment, 8-fold or higher speedups are possible.
A sufficiently large alignment is required for meaningful results. As a minimum, an alignment with an effective (after-weighting) sequence count bigger than the length of the query sequence should be used. Alignments with tens of thousands of (effective) sequences are considered good input.
jackhmmer(1) from the hmmer package, or hhblits(1) from hhsuite can be used to generate the alignments, for example.
This package contains the Python3 binding.
Inne pakiety związane z python3-freecontact
|
|
|
|
-
- dep: libboost-python1.83.0 (>= 1.83.0)
- Boost.Python Library
-
- dep: libboost-python1.83.0-py312
- pakiet wirtualny udostępniany przez libboost-python1.83.0
-
- dep: libc6 (>= 2.32)
- Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
-
- dep: libfreecontact0t64 (>= 1.0.21)
- fast protein contact predictor library
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- Biblioteka wspomagająca GCC
-
- dep: libstdc++6 (>= 11)
- Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
-
- dep: python3 (<< 3.13)
- Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)
- dep: python3 (>= 3.12~)
Pobieranie python3-freecontact
Architektura | Rozmiar pakietu | Rozmiar po instalacji | Pliki |
---|---|---|---|
mips64el | 71,5 KiB | 280,0 KiB | [lista plików] |