Pakiet: clustalx (2.1+lgpl-9 i inne)

[ Pakiet źródłowy: clustalx  ]

Multiple alignment of nucleic acid and protein sequences (graphical interface)

This package offers a GUI interface for the Clustal multiple sequence alignment program. It provides an integrated environment for performing multiple sequence- and profile-alignments to analyse the results. The sequence alignment is displayed in a window on the screen. A versatile coloring scheme has been incorporated to highlight conserved features in the alignment. For professional presentations, one should use the texshade LaTeX package or boxshade.

The pull-down menus at the top of the window allow you to select all the options required for traditional multiple sequence and profile alignment. You can cut-and-paste sequences to change the order of the alignment; you can select a subset of sequences to be aligned; you can select a sub-range of the alignment to be realigned and inserted back into the original alignment.

An alignment quality analysis can be performed and low-scoring segments or exceptional residues can be highlighted.

Znaczniki: Biologia: Clustal/ALN, Białka, Dziedzina: field::biology, field::biology:bioinformatics, Zaimplementowane w: implemented-in::c, interface::commandline, Interfejs użytkownika: Graphical User Interface, interface::x11, role::program, Zakres: Narzędzie, Pakiet narzędziowy interfejsu: Lesstif/Motif, uitoolkit::qt, use::analysing, Przeznaczenie: Porównywanie, use::viewing, works-with-format::plaintext, Działa z: Wymaga dodatkowego znacznika, X Window System: Aplikacja

Inne pakiety związane z clustalx

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libqt5core5t64 (>= 5.7.0)

  Qt 5 core module

• dep: libqt5gui5t64 (>= 5.2.0)

  Qt 5 GUI module

  lub libqt5gui5-gles (>= 5.2.0)

  Qt 5 GUI module — OpenGL ES variant

• dep: libqt5widgets5t64 (>= 5.0.2)

  Qt 5 widgets module

• dep: libqt5xml5t64 (>= 5.0.2)

  Qt 5 XML module

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• sug: boxshade

  Pretty-printing of multiple sequence alignments

• sug: clustalw

  global multiple nucleotide or peptide sequence alignment

• sug: texlive-latex-extra

  TeX Live: LaTeX additional packages

Pobieranie clustalx

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
mips64el	2.1+lgpl-9+b1	395,1 KiB	1 726,0 KiB	[lista plików]