Pakiet: libwfa2-0 (2.3.3-4 i inne)

[ Pakiet źródłowy: libwfa2  ]

exact gap-affine algorithm (shared library)

The wavefront alignment (WFA) algorithm is an exact gap-affine algorithm that takes advantage of homologous regions between the sequences to accelerate the alignment process. Unlike to traditional dynamic programming algorithms that run in quadratic time, the WFA runs in time O(ns+s^2), proportional to the sequence length n and the alignment score s, using O(s^2) memory (or O(s) using the ultralow/BiWFA mode). Moreover, the WFA algorithm exhibits simple computational patterns that the modern compilers can automatically vectorize for different architectures without adapting the code. To intuitively illustrate why the WFA algorithm is so interesting, look at the following figure. The left panel shows the cells computed by a classical dynamic programming based algorithm (like Smith-Waterman or Needleman Wunsch). In contrast, the right panel shows the cells computed by the WFA algorithm to obtain the same result (i.e., the optimal alignment).

Znaczniki: Rola: Biblioteka współdzielona

Inne pakiety związane z libwfa2-0

• dep: libc6 (>= 2.17) [nie riscv64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

Pobieranie libwfa2-0

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	2.3.3-4+b2	59,4 KiB	185,0 KiB	[lista plików]
arm64	2.3.3-4+b2	53,8 KiB	277,0 KiB	[lista plików]
mips64el	2.3.3-4+b2	55,1 KiB	293,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	2.3.3-4+b2	65,8 KiB	277,0 KiB	[lista plików]
riscv64	2.3.3-4+b2	59,2 KiB	161,0 KiB	[lista plików]
s390x	2.3.3-4+b2	62,0 KiB	201,0 KiB	[lista plików]