[ Pakiet źródłowy: placnet ]
Pakiet: placnet (1.04-1)
Odnośniki dla placnet
Zasoby systemu Debian:
- Raporty o błędach
- Developer Information
- Dziennik zmian w systemie Debian
- Informacje nt. praw autorskich
- Śledzenie łatek systemu Debian
Pobieranie pakietu źródłowego placnet:
Opiekunowie:
Zasoby zewnętrzne:
- Strona internetowa [sourceforge.net]
Podobne pakiety:
Projekt "Plasmid Constellation Network"
Placnet jest nowym narzędziem do analizy plazmidów w projektach NGS. Placnet został zoptymalizowany do pracy z sekwencjami Illumina, ale współpracuje również z 454 (Roche), Ion Torrent lub dowolną istniejącą technologią sekwencjonowania.
Dane wejściowe Placnet to zestaw kontigów i jeden lub więcej plików w formacie SAM z mapowaniem odczytów na kontigi. Placnet uzyskuje zestaw plików, który można łatwo otworzyć w programie Cytoscape lub w innych narzędziach sieciowych.
Inne pakiety związane z placnet
|
|
|
|
-
- dep: ncbi-blast+
- next generation suite of BLAST sequence search tools
Pobieranie placnet
| Architektura | Rozmiar pakietu | Rozmiar po instalacji | Pliki |
|---|---|---|---|
| all | 10,7 KiB | 38,0 KiB | [lista plików] |