Pakiet: ataqv (1.3.1+ds-2 i inne)

[ Pakiet źródłowy: ataqv  ]

Kontrola jakości i wizualizacja ATAC-seq

Zestaw narzędzi do mierzenia i porównywania wyników ATAC-seq, stworzony w laboratorium Parkera na Uniwersytecie Michigan. Został on napisany, aby pomóc zrozumieć, jak dobrze działały testy ATAC-seq, i aby ułatwić wykrywanie różnic, które mogą być spowodowane przygotowaniem biblioteki lub sekwencjonowaniem.

Znaczniki: Pakiet narzędziowy interfejsu: Ncurses (terminalowy)

Inne pakiety związane z ataqv

• dep: fonts-font-awesome

  iconic font designed for use with Twitter Bootstrap

• dep: libboost-chrono1.83.0t64 (>= 1.83.0)

  C++ representation of time duration, time point, and clocks

• dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)

  filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++

• dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)

  Biblioteka Boost.Iostreams

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.5)

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libjs-jquery

  JavaScript library for dynamic web applications

• dep: libjs-jquery-datatables

  jQuery plug-in that makes nice tables from different data sources

• dep: libjs-jquery-datatables-extensions

  extensions for the jQuery plug-in for tables from different data sources

• dep: libncurses6 (>= 6)

  Biblioteki współdzielone przeznaczone do obsługi terminala

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: node-d3

  Data-Driven Documents to visualize data

• dep: node-normalize.css

  Modern alternative to CSS resets

• dep: python3

  Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

• sug: macs

  Model-based Analysis of ChIP-Seq on short reads sequencers

• sug: picard-tools

  Command line tools to manipulate SAM and BAM files

• sug: samtools

  Przetwarzanie dopasowań sekwencji w formatach SAM, BAM i CRAM

• sug: wget

  Narzędzie pobierające pliki z Internetu

Pobieranie ataqv

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
armel	1.3.1+ds-2+b2	3 238,7 KiB	6 232,0 KiB	[lista plików]