Pakiet: sspace (2.1.1+dfsg-7)

Odnośniki dla sspace

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego sspace:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

scaffolding pre-assembled contigs after extension

SSAKE-based Scaffolding of Pre-Assembled Contigs after Extension (SSPACE) is a script able to extend and scaffold pre-assembled contigs using one or more mate pairs or paired-end libraries, or even a combination.

SSPACE is built based on SSAKE. Code of SSAKE is changed to be able to extend and scaffold pre-assembled contigs for multiple paired reads libraries.

This is the free 'basic' version of SSPACE. The non-free 'standard' version is available directly from Baseclear.

Inne pakiety związane z sspace

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: bowtie

Ultrafast memory-efficient short read aligner
dep: perl

praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla
dep: python3

Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

Pobieranie sspace

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
all	1 208,3 KiB	4 651,0 KiB	[lista plików]