Pakiet źródłowy: cnvkit (0.9.10-3~0exp0)
Odnośniki dla cnvkit
Zasoby systemu Debian:
- Raporty o błędach
- Developer Information
- Dziennik zmian w systemie Debian
- Informacje nt. praw autorskich
- Repozytorium kodu źródłowego Debiana (Git)
- Śledzenie łatek systemu Debian
Opiekunowie:
- Debian Med Packaging Team (Strona QA, Archiwum e-mail)
- Michael R. Crusoe (Strona QA)
- Steffen Moeller (Strona QA)
- Olivier Sallou (Strona QA)
Zasoby zewnętrzne:
- Strona internetowa [cnvkit.readthedocs.org]
Pakiet eksperymentalny
Ostrzeżenie: Pakiet pochodzi z dystrybucji eksperymentalnej. Oznacza to, że prawdopodobnie jest niestabilny lub zawiera błędy i może spowodować nawet utratę danych. Przed użyciem pakietu proszę koniecznie zapoznać się z dziennikiem zmian i inną dostępną dokumentacją.
Z tego pakietu źródłowego zbudowano następujące pakiety binarne:
- cnvkit
- Copy number variant detection from targeted DNA sequencing
Inne pakiety związane z cnvkit
|
|
-
- adep: debhelper-compat (= 13)
- Pakiet niedostępny
-
- adep: dh-sequence-python3
- pakiet wirtualny udostępniany przez dh-python
-
- adep: python3-all
- package depending on all supported Python 3 runtime versions
-
- adep: python3-setuptools
- Python3 Distutils Enhancements
-
- adep: pybuild-plugin-pyproject
- Debian helper tools for packaging Python libraries using PEP517
-
- adep: python3-pytest
- Simple, powerful testing in Python3
-
- adep: python3-pyfaidx
- efficient random access to fasta subsequences for Python 3
-
- adep: python3-biopython
- Python3 library for bioinformatics
-
- adep: python3-pandas
- data structures for "relational" or "labeled" data
-
- adep: python3-numpy
- Python library for numerical computations (Python 3)
-
- adep: python3-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
-
- adep: python3-scipy
- Narzędzia naukowe dla Pythona 3
-
- adep: python3-matplotlib
- System do rysowania wykresów oparty na Pythonie w stylu podobnym do Matlaba
-
- adep: python3-pomegranate
- Fast, flexible and easy to use probabilistic modelling
-
- adep: r-bioc-dnacopy (>= 1.78.0)
- R package: DNA copy number data analysis
-
- adep: poppler-utils
- PDF utilities (based on Poppler)
Download cnvkit
| Plik | Rozmiar (w KiB) | Suma kontrolna MD5 |
|---|---|---|
| cnvkit_0.9.10-3~0exp0.dsc | 2,4 KiB | a972ab0601e5875fef47fac07f33125e |
| cnvkit_0.9.10.orig.tar.gz | 23 108,4 KiB | ac1e8d636fc0fc694d1475a212d0cf98 |
| cnvkit_0.9.10-3~0exp0.debian.tar.xz | 17,3 KiB | d6423a6acc31aea516cf9f337be69c58 |
- Repozytorium kodu źródłowego Debiana (VCS: Git)
- https://salsa.debian.org/med-team/cnvkit.git
- Repozytorium kodu źródłowego Debiana (do przeglądania)
- https://salsa.debian.org/med-team/cnvkit