Pakiet: infernal (1.1.5-3) [debports]

[ Pakiet źródłowy:  ]

Wyrównywanie drugorzędowej struktury RNA

Infernal ("INFERence of RNA ALignment") przeszukuje bazę danych w celu znalezienia sekwencji DNA (i sekwencji podobnych) w strukturze RNA. Dostarcza implementację szczególnego wariantu profilu stochastycznych gramatyk bezkontekstowych zwanych modelami kowariancji (CMs). CM (model kowariancji) przypomina profil sekwencji, za wyjątkiem zgodności wyniku kombinacji sekwencji i struktur drugorzędowych RNA. Z tego powodu, w wielu przypadkach, znacznie łatwiej jest zidentyfikować homologi RNA, które zachowują swoją drugorzędową strukturę, niż ich pierwotną sekwencję.

Narzędzie jest integralną częścią bazy danych Rfam.

Inne pakiety związane z infernal

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

Pobieranie infernal

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
x32 (port nieoficjalny)	5 782,7 KiB	51 130,0 KiB	[lista plików]