Pakiet: tree-puzzle (5.3~rc16+dfsg-12 i inne) [debports]

[ Pakiet źródłowy:  ]

Rekonstrukcja drzew filogenetycznych metodą maksymalnego prawdopodobieństwa

TREE-PUZZLE (nowa nazwa dla programu PUZZLE) to interaktywny program konsolowy, który implementuje algorytm (quartet puzzling) do szybkiego przeszukiwania drzew, umożliwiający analizę dużych zbiorów danych i automatycznie przypisujący estymacje wsparcia do każdej wewnętrznej gałęzi. TREE-PUZZLE oblicza również maksymalne prawdopodobieństwo oddalenia par oraz długości gałęzi dla drzew określonych przez użytkownika. Długość gałęzi można również obliczyć, przyjmując założenia zegara. Ponadto TREE-PUZZLE oferuje nowatorską metodę mapowania prawdopodobieństwa, która pozwala na zbadanie wsparcia hipotetycznej gałęzi wewnętrznej bez konieczności obliczania całego drzewa oraz na wizualizację zawartości filogenetycznej dopasowania sekwencji.

Inne pakiety związane z tree-puzzle

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libsprng2

  SPRNG Scalable Parallel RNG library -- library package

• rec: tree-puzzle-doc

  Reconstruction of phylogenetic trees by maximum likelihood (doc)

• sug: phylip

  package of programs for inferring phylogenies

• sug: treetool

  Pakiet niedostępny

Pobieranie tree-puzzle

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
sparc64 (port nieoficjalny)	5.3~rc16+dfsg-12+b1	153,5 KiB	1 070,0 KiB	[lista plików]