Pakiet: r-bioc-decontam (1.26.0+dfsg-2)

[ Pakiet źródłowy: r-bioc-decontam  ]

identify contaminants in marker-gene and metagenomics sequencing sata

Simple statistical identification of contaminating sequence features in marker-gene or metagenomics data. Works on any kind of feature derived from environmental sequencing data (e.g. ASVs, OTUs, taxonomic groups, MAGs,...). Requires DNA quantitation data or sequenced negative control samples.

Inne pakiety związane z r-bioc-decontam

• dep: r-api-4.0

  pakiet wirtualny udostępniany przez r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.20

  pakiet wirtualny udostępniany przez r-bioc-biocgenerics

• dep: r-cran-ggplot2 (>= 2.1.0)

  implementation of the Grammar of Graphics

• dep: r-cran-reshape2 (>= 1.4.1)

  Flexibly reshape data: a reboot of the reshape package

• sug: r-bioc-biocstyle

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-bioc-phyloseq

  GNU R handling and analysis of high-throughput microbiome census data

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

Pobieranie r-bioc-decontam

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
all	205,9 KiB	285,0 KiB	[lista plików]