Pakiet: ncbi-blast+ (2.16.0+ds-6 i inne)

[ Pakiet źródłowy: ncbi-blast+  ]

next generation suite of BLAST sequence search tools

The Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) is the most widely used sequence similarity tool. There are versions of BLAST that compare protein queries to protein databases, nucleotide queries to nucleotide databases, as well as versions that translate nucleotide queries or databases in all six frames and compare to protein databases or queries. PSI-BLAST produces a position-specific-scoring-matrix (PSSM) starting with a protein query, and then uses that PSSM to perform further searches. It is also possible to compare a protein or nucleotide query to a database of PSSM’s. The NCBI supports a BLAST web page at blast.ncbi.nlm.nih.gov as well as a network service.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c++, interface::commandline, Rola: Program, Przeznaczenie: use::analysing, works-with::biological-sequence

Inne pakiety związane z ncbi-blast+

• dep: libbz2-1.0

  Wysokiej jakości biblioteka kompresji plików - wersja uruchomieniowa

• dep: libc6 (>= 2.38)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 4.2)

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgomp1 (>= 6)

  Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)

• dep: liblmdb0 (>= 0.9.7)

  Biblioteka współdzielona LMDB (Lightning Memory-Mapped Database)

• dep: libmbedcrypto16 (>= 3.6.0)

  lightweight crypto and SSL/TLS library - crypto library

• dep: libmbedtls21 (>= 3.6.0)

  lightweight crypto and SSL/TLS library - tls library

• dep: libmbedx509-7 (>= 3.6.0)

  lightweight crypto and SSL/TLS library - x509 certificate library

• dep: libnghttp2-14 (>= 1.28.0)

  Biblioteka implementująca protokół HTTP/2 (biblioteka współdzielona)

• dep: libpcre2-8-0 (>= 10.22)

  Nowa biblioteka wyrażeń regularnych zgodna z Perl - 8-bitowe pliki uruchomieniowe

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.6.12)

  Biblioteka współdzielona SQLite 3

• dep: libstdc++6 (>= 14)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: libuv1t64 (>= 1.33.1)

  asynchronous event notification library - runtime library

• dep: ncbi-data

  Platform-independent data for the NCBI toolkit

• dep: perl

  praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla

• dep: python3

  Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.11.dfsg)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

• enh: t-coffee

  Wielosekwencyjne wyrównanie

Pobieranie ncbi-blast+

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
ppc64el	2.16.0+ds-6+b1	14 624,6 KiB	79 174,0 KiB	[lista plików]