Pakiet: igdiscover (0.11-4)

[ Pakiet źródłowy: igdiscover  ]

analyzes antibody repertoires to find new V genes

IgDiscover analyzes antibody repertoires and discovers new V genes from high-throughput sequencing reads. Heavy chains, kappa and lambda light chains are supported (to discover VH, VK and VL genes).

Inne pakiety związane z igdiscover

• dep: python3

  Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

• dep: python3-cutadapt

  Clean biological sequences from high-throughput sequencing reads (Python 3)

• dep: python3-matplotlib (>= 1.5.0)

  System do rysowania wykresów oparty na Pythonie w stylu podobnym do Matlaba

• dep: python3-numpy

  Szybkie zarządzanie tablicami w języku Python (Python 3)

• dep: python3-pandas (>= 0.16.2)

  data structures for "relational" or "labeled" data

• dep: python3-ruamel.yaml

  Roundtrip YAML parser/emitter (Python 3 module)

• dep: python3-scipy (>= 0.16.1)

  Narzędzia naukowe dla Pythona 3

• dep: python3-seaborn (>= 0.9)

  statistical visualization library for Python3

• dep: python3-sqt

  SeQuencing Tools for biological DNA/RNA high-throughput data

• dep: python3-xopen (>= 0.3.2)

  Python3 module to open compressed files transparently

• sug: igdiscover-doc

  analyzes antibody repertoires to find new V genes - doc

• sug: snakemake

  pythonic workflow management system

Pobieranie igdiscover

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
all	35,9 KiB	46,0 KiB	[lista plików]