Pakiet: bowtie (1.3.1-3) [debports]
Odnośniki dla bowtie
Zasoby systemu Debian:
Pobieranie pakietu źródłowego :
Nie znalezionoOpiekunowie:
Zasoby zewnętrzne:
- Strona internetowa [bowtie-bio.sourceforge.net]
Podobne pakiety:
Ultrafast memory-efficient short read aligner
This package addresses the problem to interpret the results from the latest (2010) DNA sequencing technologies. Those will yield fairly short stretches and those cannot be interpreted directly. It is the challenge for tools like Bowtie to give a chromosomal location to the short stretches of DNA sequenced per run.
Bowtie aligns short DNA sequences (reads) to the human genome at a rate of over 25 million 35-bp reads per hour. Bowtie indexes the genome with a Burrows-Wheeler index to keep its memory footprint small: typically about 2.2 GB for the human genome (2.9 GB for paired-end).
Inne pakiety związane z bowtie
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- Biblioteka wspomagająca GCC
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
-
- dep: python3
- Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)
- Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze
-
- sug: bowtie-examples
- Examples for bowtie, the ultrafast memory-efficient short read aligner
Pobieranie bowtie
Architektura | Rozmiar pakietu | Rozmiar po instalacji | Pliki |
---|---|---|---|
ppc64 (port nieoficjalny) | 1 328,0 KiB | 8 145,0 KiB | [lista plików] |