Pakiet: bioawk (1.0-5) [debports]

[ Pakiet źródłowy:  ]

Rozszerzenie awk do analizowania sekwencji biologicznych

Bioawk jest rozszerzeniem programu awk napisanego przez Briana Kernighana, dodającym obsługę kilku popularnych formatów danych biologicznych, w tym opcjonalnie spakowanych gzipem formatów BED, GFF, SAM, VCF, FASTA/Q oraz formatów rozdzielanych tabulatorami z nazwami kolumn. Dodaje także kilka wbudowanych funkcji i opcję wiersza poleceń, aby używać znaku tabulatora jako ogranicznika danych wejściowych/wyjściowych. Gdy nowa funkcjonalność nie jest używana, bioawk zachowuje się dokładnie tak samo, jak oryginalny BWK awk.

Inne pakiety związane z bioawk

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie bioawk

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
ppc64 (port nieoficjalny)	59,4 KiB	211,0 KiB	[lista plików]