Pakiet: samtools (1.20-3) [debports]
Odnośniki dla samtools
Zasoby systemu Debian:
Pobieranie pakietu źródłowego :
Nie znalezionoOpiekunowie:
Zasoby zewnętrzne:
- Strona internetowa [www.htslib.org]
Podobne pakiety:
Przetwarzanie dopasowań sekwencji w formatach SAM, BAM i CRAM
Samtools to zestaw narzędzi zarządzających dopasowaniami sekwencji nukleotydów w binarnym formacie BAM. Importuje i eksportuje do formatów ascii SAM (Sequence Alignment/Map) i CRAM, sortuje, łączy i indeksuje, a także umożliwia szybkie pobieranie odczytów z dowolnych regionów. Został zaprojektowany do pracy na strumieniu i może otwierać plik BAM lub CRAM (ale nie w formacie SAM) na zdalnym serwerze FTP lub HTTP.
Inne pakiety związane z samtools
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
-
- dep: libhts3t64 (>= 1.20~)
- C library for high-throughput sequencing data formats
-
- dep: libncurses6 (>= 6)
- Biblioteki współdzielone przeznaczone do obsługi terminala
-
- dep: libtinfo6 (>= 6)
- Współdzielona, niskopoziomowa biblioteka terminfo do obsługi terminala
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)
- Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze
-
- sug: cwltool
- Common Workflow Language reference implementation
Pobieranie samtools
Architektura | Rozmiar pakietu | Rozmiar po instalacji | Pliki |
---|---|---|---|
hppa (port nieoficjalny) | 634,3 KiB | 1 371,0 KiB | [lista plików] |