Pakiet: disulfinder (1.2.11-12 i inne)

[ Pakiet źródłowy: disulfinder  ]

cysteines disulfide bonding state and connectivity predictor

'disulfinder' is for predicting the disulfide bonding state of cysteines and their disulfide connectivity starting from sequence alone. Disulfide bridges play a major role in the stabilization of the folding process for several proteins. Prediction of disulfide bridges from sequence alone is therefore useful for the study of structural and functional properties of specific proteins. In addition, knowledge about the disulfide bonding state of cysteines may help the experimental structure determination process and may be useful in other genomic annotation tasks.

'disulfinder' predicts disulfide patterns in two computational stages: (1) the disulfide bonding state of each cysteine is predicted by a BRNN-SVM binary classifier; (2) cysteines that are known to participate in the formation of bridges are paired by a Recursive Neural Network to obtain a connectivity pattern.

Znaczniki: Rola: Program

Inne pakiety związane z disulfinder

• dep: disulfinder-data

  data files for predictor of disulfide bonds in proteins

• dep: libc6 (>= 2.33) [nie alpha, arm64, ia64, riscv64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.33) [alpha, ia64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libstdc++6 (>= 11) [nie arm64, riscv64]

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [arm64, riscv64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe

Pobieranie disulfinder

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1.2.11-12	223,7 KiB	773,0 KiB	[lista plików]
amd64	1.2.11-12	233,3 KiB	676,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.2.11-12+b1	213,5 KiB	699,0 KiB	[lista plików]
armel	1.2.11-12	185,2 KiB	567,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.2.11-12	190,6 KiB	411,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	1.2.11-12	214,0 KiB	606,0 KiB	[lista plików]
i386	1.2.11-12	242,0 KiB	707,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	1.2.11-12	296,9 KiB	1 363,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	1.2.11-12	209,3 KiB	619,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.2.11-12	203,5 KiB	744,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	1.2.11-12	227,5 KiB	828,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.2.11-12	236,6 KiB	764,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.2.11-12+b1	226,4 KiB	508,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.2.11-12	203,5 KiB	676,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	1.2.11-12	262,2 KiB	584,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	1.2.11-12	183,4 KiB	609,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	1.2.11-12	232,1 KiB	635,0 KiB	[lista plików]